La Escuela N°312 Molokai fue fundada por la Congregación Religiosa de la Preciosa Sangre en 1954, en la antigua comuna de Barrancas, donde hoy se ubica Cerro Navia.
En el año 1976 el establecimiento educacional fue traspasado a la Corporación Molokai, fundada por el padre Gregorio Sánchez en 1964.
Durante el año 2012, la administración del colegio fue asumida por la Fundación Belén Educa, cambiando su nombre definitivo en 2016 a colegio San Damián de Molokai, impartiendo en la actualidad enseñanza para niños, niñas y jóvenes desde Prekínder a Cuarto Medio y las especialidades Técnico Profesionales de Telecomunicaciones y Administración mención Recursos Humanos.